La moitié de l’activité photosynthétique sur Terre a lieu dans l’océan et est assurée par le phytoplancton. Les virus étant une cause majeure de mortalité du phytoplancton, ils régulent les populations de leurs hôtes et les cycles biogéochimiques. Parmi les virus qui infectent le phytoplancton, les prasinovirus, des virus à ADN ‘géant’ infectent des algues vertes qui sont les plus petites connues au monde (taille de cellule: 1 μm), notamment l’espèce Ostreococcus tauri. Malgré leur importance écologique, on ne sait quasiment rien de la diversité et de l’évolution des interactions algues-virus. Sur de courtes échelles de temps, les interactions hôte-virus sont fondamentalement antagonistes. Sur de longues échelles de temps, les hôtes et les virus dans les océans ont probablement coexisté pendant des millions d’années. La possibilité d’isoler, de cultiver et de réaliser facilement de la génomique fonctionnelle sur Ostreococcus et leurs prasinovirus en fait un système exceptionnel pour découvrir la diversité et l’évolution des interactions phytoplancton-virus, et comment elles sont affectées par les changements environnementaux.